外源化合物在鱼体内生物半减期的QSAR模型

张文灏, 陈景文, 徐童, 王雅. 外源化合物在鱼体内生物半减期的QSAR模型[J]. 生态毒理学报, 2019, 14(3): 90-98. doi: 10.7524/AJE.1673-5897.20180311001
引用本文: 张文灏, 陈景文, 徐童, 王雅. 外源化合物在鱼体内生物半减期的QSAR模型[J]. 生态毒理学报, 2019, 14(3): 90-98. doi: 10.7524/AJE.1673-5897.20180311001
Zhang Wenhao, Chen Jingwen, Xu Tong, Wang Ya. QSAR Models for Predicting Biological Half-life of Xenobiotics in Fish[J]. Asian Journal of Ecotoxicology, 2019, 14(3): 90-98. doi: 10.7524/AJE.1673-5897.20180311001
Citation: Zhang Wenhao, Chen Jingwen, Xu Tong, Wang Ya. QSAR Models for Predicting Biological Half-life of Xenobiotics in Fish[J]. Asian Journal of Ecotoxicology, 2019, 14(3): 90-98. doi: 10.7524/AJE.1673-5897.20180311001

外源化合物在鱼体内生物半减期的QSAR模型

    作者简介: 张文灏(1991-),女,硕士,研究方向为污染生态化学及毒理学,E-mail:zhang_w_h@outlook.com
  • 基金项目:

    国家自然科学基金(21661142001)

  • 中图分类号: X171.5

QSAR Models for Predicting Biological Half-life of Xenobiotics in Fish

  • Fund Project:
  • 摘要: 生物半减期(t1/2)是评价外源化合物在鱼体内蓄积效应的重要参数。实验测定t1/2的速度慢、成本高,难以满足化学品生态风险评价的需求,需要发展替代实验的模型预测方法。本研究搜集了653种化合物t1/2实测值,采用多元线性回归(MLR)和支持向量机(SVM) 2种方法,建立了鱼体logt1/2的定量构效关系(QSAR)预测模型。MLR模型的校正决定系数(Radj2)为0.751,均方根误差(RMSEtrain)为0.587,去一法交叉验证系数(QLOO2)为0.735,外部验证系数(Qext2)为0.682,这表明模型具有较好的拟合度、稳健性和预测能力。SVM模型具有更好的拟合和预测能力(Radj2 = 0.839, RMSEtrain = 0.457, Qext2 = 0.708)。采用Williams法对模型的应用域进行表征。所建模型可用于预测多环芳烃、多氯联苯、多溴联苯醚、有机磷农药、药物等典型化合物,以及其他烷烃、环烷烃、烯烃、醇、醚、酸、酯、酮、含卤素化合物、芳香族化合物、含硫、氮、磷化合物的在鱼体内的logt1/2值。
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出版历程
  • 收稿日期:  2018-03-11
张文灏, 陈景文, 徐童, 王雅. 外源化合物在鱼体内生物半减期的QSAR模型[J]. 生态毒理学报, 2019, 14(3): 90-98. doi: 10.7524/AJE.1673-5897.20180311001
引用本文: 张文灏, 陈景文, 徐童, 王雅. 外源化合物在鱼体内生物半减期的QSAR模型[J]. 生态毒理学报, 2019, 14(3): 90-98. doi: 10.7524/AJE.1673-5897.20180311001
Zhang Wenhao, Chen Jingwen, Xu Tong, Wang Ya. QSAR Models for Predicting Biological Half-life of Xenobiotics in Fish[J]. Asian Journal of Ecotoxicology, 2019, 14(3): 90-98. doi: 10.7524/AJE.1673-5897.20180311001
Citation: Zhang Wenhao, Chen Jingwen, Xu Tong, Wang Ya. QSAR Models for Predicting Biological Half-life of Xenobiotics in Fish[J]. Asian Journal of Ecotoxicology, 2019, 14(3): 90-98. doi: 10.7524/AJE.1673-5897.20180311001

外源化合物在鱼体内生物半减期的QSAR模型

    作者简介: 张文灏(1991-),女,硕士,研究方向为污染生态化学及毒理学,E-mail:zhang_w_h@outlook.com
  • 工业生态与环境工程教育部重点实验室, 大连理工大学环境学院, 大连 116024
基金项目:

国家自然科学基金(21661142001)

摘要: 生物半减期(t1/2)是评价外源化合物在鱼体内蓄积效应的重要参数。实验测定t1/2的速度慢、成本高,难以满足化学品生态风险评价的需求,需要发展替代实验的模型预测方法。本研究搜集了653种化合物t1/2实测值,采用多元线性回归(MLR)和支持向量机(SVM) 2种方法,建立了鱼体logt1/2的定量构效关系(QSAR)预测模型。MLR模型的校正决定系数(Radj2)为0.751,均方根误差(RMSEtrain)为0.587,去一法交叉验证系数(QLOO2)为0.735,外部验证系数(Qext2)为0.682,这表明模型具有较好的拟合度、稳健性和预测能力。SVM模型具有更好的拟合和预测能力(Radj2 = 0.839, RMSEtrain = 0.457, Qext2 = 0.708)。采用Williams法对模型的应用域进行表征。所建模型可用于预测多环芳烃、多氯联苯、多溴联苯醚、有机磷农药、药物等典型化合物,以及其他烷烃、环烷烃、烯烃、醇、醚、酸、酯、酮、含卤素化合物、芳香族化合物、含硫、氮、磷化合物的在鱼体内的logt1/2值。

English Abstract

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