基于高通量定量PCR研究城市化小流域微生物污染特征

庄芳芳, 苏建强, 陈辉煌, 朱永官. 基于高通量定量PCR研究城市化小流域微生物污染特征[J]. 生态毒理学报, 2017, 12(5): 141-152. doi: 10.7524/AJE.1673-5897.20170307003
引用本文: 庄芳芳, 苏建强, 陈辉煌, 朱永官. 基于高通量定量PCR研究城市化小流域微生物污染特征[J]. 生态毒理学报, 2017, 12(5): 141-152. doi: 10.7524/AJE.1673-5897.20170307003
Zhuang Fangfang, Su Jianqiang, Chen Huihuang, Zhu Yongguan. Characterization of Microbial Contaminants Using High-throughput Quantitative PCR in a Small Urbanizing Catchment[J]. Asian Journal of Ecotoxicology, 2017, 12(5): 141-152. doi: 10.7524/AJE.1673-5897.20170307003
Citation: Zhuang Fangfang, Su Jianqiang, Chen Huihuang, Zhu Yongguan. Characterization of Microbial Contaminants Using High-throughput Quantitative PCR in a Small Urbanizing Catchment[J]. Asian Journal of Ecotoxicology, 2017, 12(5): 141-152. doi: 10.7524/AJE.1673-5897.20170307003

基于高通量定量PCR研究城市化小流域微生物污染特征

    作者简介: 庄芳芳(1992-),女,硕士研究生,研究方向为环境微生物学,E-mail:taiyangrenzff@163.com
  • 基金项目:

    国家自然科学基金(31722004);国家重点研发计划重点专项(2016YFD0800205)

  • 中图分类号: X171.5

Characterization of Microbial Contaminants Using High-throughput Quantitative PCR in a Small Urbanizing Catchment

  • Fund Project:
  • 摘要: 水体微生物污染(包括致病菌、病毒、寄生虫)会引起多种传染病和寄生虫病,对生产生活用水安全和人体健康造成重要威胁。本研究应用基于TaqMan探针的高通量荧光定量PCR技术对厦门市后溪流域冬季微生物污染进行检测,包含了5种粪便污染源(人源、反刍动物源、猪源、家禽源、狗源)微生物源示踪分子标记物与12种病原微生物。结果表明,该流域在上游及水库5个位点没有粪便污染,仅在其中一个水库位点检测出棘阿米巴,微生物污染极小;中下游检测出人类、反刍动物、猪、家禽、狗粪便污染,并且检测出产气荚膜梭菌、肠聚集性大肠杆菌、肠毒素型大肠杆菌、幽门螺杆菌、霍乱弧菌、副溶血弧菌、棘阿米巴、克雷伯氏肺炎杆菌等病原菌,其中流经旧城区居民生活生产区水样微生物污染严重,下游新城区微生物污染较小。这些结果暗示着城市人类活动是流域微生物污染主要来源,应从污染源头加强微生物污染控制。
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出版历程
  • 收稿日期:  2017-03-07

基于高通量定量PCR研究城市化小流域微生物污染特征

    作者简介: 庄芳芳(1992-),女,硕士研究生,研究方向为环境微生物学,E-mail:taiyangrenzff@163.com
  • 1. 中国科学院城市环境研究所城市环境与健康重点实验室, 厦门 361021;
  • 2. 中国科学院大学, 北京 100049
基金项目:

国家自然科学基金(31722004);国家重点研发计划重点专项(2016YFD0800205)

摘要: 水体微生物污染(包括致病菌、病毒、寄生虫)会引起多种传染病和寄生虫病,对生产生活用水安全和人体健康造成重要威胁。本研究应用基于TaqMan探针的高通量荧光定量PCR技术对厦门市后溪流域冬季微生物污染进行检测,包含了5种粪便污染源(人源、反刍动物源、猪源、家禽源、狗源)微生物源示踪分子标记物与12种病原微生物。结果表明,该流域在上游及水库5个位点没有粪便污染,仅在其中一个水库位点检测出棘阿米巴,微生物污染极小;中下游检测出人类、反刍动物、猪、家禽、狗粪便污染,并且检测出产气荚膜梭菌、肠聚集性大肠杆菌、肠毒素型大肠杆菌、幽门螺杆菌、霍乱弧菌、副溶血弧菌、棘阿米巴、克雷伯氏肺炎杆菌等病原菌,其中流经旧城区居民生活生产区水样微生物污染严重,下游新城区微生物污染较小。这些结果暗示着城市人类活动是流域微生物污染主要来源,应从污染源头加强微生物污染控制。

English Abstract

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