稀有鮈鲫神经发育相关基因的克隆、同源性分析及组织分布

陈曦, 洪响生, 吴慧敏, 查金苗, 覃剑晖. 稀有鮈鲫神经发育相关基因的克隆、同源性分析及组织分布[J]. 生态毒理学报, 2016, 11(1): 173-181. doi: 10.7524/AJE.1673-5897.20150515001
引用本文: 陈曦, 洪响生, 吴慧敏, 查金苗, 覃剑晖. 稀有鮈鲫神经发育相关基因的克隆、同源性分析及组织分布[J]. 生态毒理学报, 2016, 11(1): 173-181. doi: 10.7524/AJE.1673-5897.20150515001
Chen Xi, Hong Xiangsheng, Wu Huimin, Zha Jinmiao, Qin Jianhui. Cloning, Homology Analysis, and Distribution of Neural Development Related Genes of Chinese Rare Minnow (Gobiocypris rarus)[J]. Asian Journal of Ecotoxicology, 2016, 11(1): 173-181. doi: 10.7524/AJE.1673-5897.20150515001
Citation: Chen Xi, Hong Xiangsheng, Wu Huimin, Zha Jinmiao, Qin Jianhui. Cloning, Homology Analysis, and Distribution of Neural Development Related Genes of Chinese Rare Minnow (Gobiocypris rarus)[J]. Asian Journal of Ecotoxicology, 2016, 11(1): 173-181. doi: 10.7524/AJE.1673-5897.20150515001

稀有鮈鲫神经发育相关基因的克隆、同源性分析及组织分布

    作者简介: 陈曦(1989-),女,硕士,研究方向为渔业资源,E-mail:chen_xi0309@sina.com
    通讯作者: 查金苗, E-mail: jmzha@rcees.ac.cn
  • 中图分类号: X171.5

Cloning, Homology Analysis, and Distribution of Neural Development Related Genes of Chinese Rare Minnow (Gobiocypris rarus)

    Corresponding author: Zha Jinmiao, jmzha@rcees.ac.cn
  • 摘要: 作为重要的本土模式鱼类,稀有鮈鲫神经发育相关的生物学背景几乎空白,导致其在神经毒性评价方面的应用受到限制。本文从稀有鮈鲫脑部克隆得到了神经发育相关的神经生长因子(nerve growth factor;ngf)、脑源性神经营养因子(brain-derived neurotrophic factor;bdnf)、胶质纤维酸性蛋白(glial fibrillary acidic protein;gfap)、髓鞘相关糖蛋白(myelin-associated glycoprotein;mag)、P0蛋白(myelin protein zero;mpz)、微管蛋白α1(α1-tubulin)和Y染色体性别决定基因10(SRY-box containing gene 10;sox10)等基因的片段,并对其进化树及表达谱进行了分析。序列分析表明,bdnf的核苷酸序列与鲫鱼、鲤鱼的同源性最高,均为98%;gfap、ngf、mag和α1-tubulin与斑马鱼的同源性最高,分别为95%、92%、92%和96%;mpz与黑头软口鲦的同源性最高,为94%;sox10与鳙鱼同源性最高,达97%。表达谱分析结果表明,ngf、bdnf、mag、mpz、α1-tubulin和sox10基因均在脑组织中表达量最高,gfap在脊髓中表达量最高,上述结果为这一模式鱼类在神经发育学和神经毒性效应评价方面的应用奠定了基础。
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出版历程
  • 收稿日期:  2015-05-15
陈曦, 洪响生, 吴慧敏, 查金苗, 覃剑晖. 稀有鮈鲫神经发育相关基因的克隆、同源性分析及组织分布[J]. 生态毒理学报, 2016, 11(1): 173-181. doi: 10.7524/AJE.1673-5897.20150515001
引用本文: 陈曦, 洪响生, 吴慧敏, 查金苗, 覃剑晖. 稀有鮈鲫神经发育相关基因的克隆、同源性分析及组织分布[J]. 生态毒理学报, 2016, 11(1): 173-181. doi: 10.7524/AJE.1673-5897.20150515001
Chen Xi, Hong Xiangsheng, Wu Huimin, Zha Jinmiao, Qin Jianhui. Cloning, Homology Analysis, and Distribution of Neural Development Related Genes of Chinese Rare Minnow (Gobiocypris rarus)[J]. Asian Journal of Ecotoxicology, 2016, 11(1): 173-181. doi: 10.7524/AJE.1673-5897.20150515001
Citation: Chen Xi, Hong Xiangsheng, Wu Huimin, Zha Jinmiao, Qin Jianhui. Cloning, Homology Analysis, and Distribution of Neural Development Related Genes of Chinese Rare Minnow (Gobiocypris rarus)[J]. Asian Journal of Ecotoxicology, 2016, 11(1): 173-181. doi: 10.7524/AJE.1673-5897.20150515001

稀有鮈鲫神经发育相关基因的克隆、同源性分析及组织分布

    通讯作者: 查金苗, E-mail: jmzha@rcees.ac.cn
    作者简介: 陈曦(1989-),女,硕士,研究方向为渔业资源,E-mail:chen_xi0309@sina.com
  • 1. 华中农业大学水产学院, 武汉 430070;
  • 2. 中国科学院生态环境研究中心 环境水质学国家重点实验室, 北京 100085

摘要: 作为重要的本土模式鱼类,稀有鮈鲫神经发育相关的生物学背景几乎空白,导致其在神经毒性评价方面的应用受到限制。本文从稀有鮈鲫脑部克隆得到了神经发育相关的神经生长因子(nerve growth factor;ngf)、脑源性神经营养因子(brain-derived neurotrophic factor;bdnf)、胶质纤维酸性蛋白(glial fibrillary acidic protein;gfap)、髓鞘相关糖蛋白(myelin-associated glycoprotein;mag)、P0蛋白(myelin protein zero;mpz)、微管蛋白α1(α1-tubulin)和Y染色体性别决定基因10(SRY-box containing gene 10;sox10)等基因的片段,并对其进化树及表达谱进行了分析。序列分析表明,bdnf的核苷酸序列与鲫鱼、鲤鱼的同源性最高,均为98%;gfap、ngf、mag和α1-tubulin与斑马鱼的同源性最高,分别为95%、92%、92%和96%;mpz与黑头软口鲦的同源性最高,为94%;sox10与鳙鱼同源性最高,达97%。表达谱分析结果表明,ngf、bdnf、mag、mpz、α1-tubulin和sox10基因均在脑组织中表达量最高,gfap在脊髓中表达量最高,上述结果为这一模式鱼类在神经发育学和神经毒性效应评价方面的应用奠定了基础。

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